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決定單細胞實驗看見什麼的那些過濾條件
本文各節分別依據哪些來源,以及整體證據基礎的樣貌。
各節所依據的來源
| 章節 | 所依據的來源 |
|---|---|
| 事實 | EmptyDrops、Scrublet、DoubletFinder、scDblFinder、SoupX、DecontX 與 CellBender 各自的方法論文(2019 至 2023 年);Osorio 與 Cai,《Bioinformatics》,2021;Xi 與 Li,《Cell Systems》,2020;Sarieva 等人,《iScience》,2026;Bloom,《PeerJ》,2018;Parse Biosciences 支援中心與資料集頁面 |
| 時序 | Ilicic 等人,《Genome Biology》(2016);Rosenberg 等人,《Science》(2018);Bloom,《PeerJ》(2018);EmptyDrops、Scrublet 與 DoubletFinder(2019);Luecken 與 Theis,《Molecular Systems Biology》(2019);DecontX 與 SoupX(2020);Xi 與 Li,《Cell Systems》(2020);Osorio 與 Cai,《Bioinformatics》(2021);scDblFinder(2021);Heumos 等人,《Nature Reviews Genetics》(2023);CellBender,《Nature Methods》(2023);Xie 等人,《International Journal of Molecular Sciences》(2024);Filippov 等人,《BMC Genomics》(2024);Sarieva 等人,《iScience》(2026);Parse Biosciences 的專利公告 |
| 論點 | Osorio 與 Cai,《Bioinformatics》(2021);Sarieva 等人,《iScience》(2026) |
| 補充 | Xie 等人,《International Journal of Molecular Sciences》(2024);Filippov 等人,《BMC Genomics》(2024);Sarieva 等人,《iScience》(2026);Xi 與 Li,《Cell Systems》(2020);scDblFinder(2021);Bloom,《PeerJ》(2018);SoupX、DecontX 與 CellBender;Parse Biosciences 支援中心與產品頁面 |
| 結論 | Osorio 與 Cai,《Bioinformatics》(2021);Sarieva 等人,《iScience》(2026);Xi 與 Li,《Cell Systems》(2020)與 scDblFinder(2021)留下的懸而未決的問題;全篇均標明出處的 Parse Biosciences 廠商資料 |
證據基礎的樣貌
- 24本文依據的來源
- 5章節,每一節都有來源
- 7全文閱畢
- 17僅讀摘要
| 來源的性質 | 數量 | 閱讀方式 |
|---|---|---|
| 同儕審查的研究論文 | 15 | 全數僅讀摘要;每一篇的全文皆須登入期刊網站方能取得 |
| 最佳實務綜述與教學文章 | 2 | 兩件皆僅讀摘要,原因相同 |
| Parse Biosciences 公司資料 | 7 | 四件透過支援網站的 API 全文取得,因其公開網頁拒絕自動存取;三件則直接從網頁全文閱畢 |
可不可靠
可靠,但有立場又可信又可靠兩者皆弱,謹慎採用立場可信,但材料薄弱
值不值得相信